崇祯十三年(1640)，张献忠犯川。先在夔州土地岭(今三峡奉节草堂镇)大破前来围剿的京营总兵张应元、汪云凤的楚师，打破杨嗣昌的围剿计划。“十七年(1644)春，献忠遂长驱犯夔州(今奉节)。良玉驰援，众寡不敌，溃。及全蜀尽陷。”随后，四川巡抚邵捷春亲率的2万新募川军也被聚歼。
奉节夔府之战，张献忠大捷，明朝在四川的最后统治势力基本灰飞烟灭。“夔州之陷，西南门户洞开”，“川东上下，鱼溃鸟惊”，“蜀中由是大乱”。张献忠犹入无人之境，从川东一路杀掠至川西，在成都建“大西国”称帝。
同年，李自成在西安建“大顺国”称帝，随后攻入北京，崇祯皇帝于北京景山自缢，明朝宣告灭亡。吴三桂引清军入关，李自成亲征山海关失利，被迫退出北京。满清随之进京，正式定都北京。这一年，中国时局变换莫测，短短四十余天，紫禁城竟然罕见地换了三朝皇帝！
1645年，李自成兵败退入湖北九宫山被杀，有史说是自缢，或传言出家。其大顺军余部转而“联明抗清”，组建南明“忠贞营”，联络各路抗清义军转战于三峡地区的奉节夔府及其周边一带，成为中国大陆“反清复明”的最后基地。
清初，欧阳直著《蜀警录》，感叹明朝末年四川这场持续近半个世纪的战乱：“天下未乱蜀先乱,天下已治蜀后治”。这就是今天四川谚语“天下未乱蜀先乱，天下已平蜀未平”的来历。
《南明：夔州与台湾最后的抗清（1659～1664）》
